Next Generation Sequencing Plattform AXELIOS 1

Roche gab die Markteinführung von AXELIOS 1 bekannt. Die Sequenzierplattform basiere auf der innovativen SBX-Technologie und biete eine besondere Kombination aus Genauigkeit, Geschwindigkeit, Flexibilität, Skalierbarkeit und Kosteneffizienz, betont das Unternehmen. Dank der flexiblen Konfiguration der Sequenzierläufe und des hohen Durchsatzes der AXELIOS 1 Plattform sollen sich sowohl kleine Studien als auch umfangreiche Genomprojekte umsetzen lassen. Somit könnten Labore ihre Forschungskapazitäten mit nur einer Plattform erweitern. Dank der Zusammenarbeit mit weltweit führenden Institutionen wie der Hartwig Medical Foundation und Broad Clinical Labs sei AXELIOS 1 von Beginn an unter real-world Bedingungen einsetzbar. Diese Kooperationen erstrecken sich auch auf die Library Preparation und auf Tools zur Datenanalyse. Hierzu zählt eine Partnerschaft mit 10x Genomics für Single-Cell- und Spatial-Anwendungen sowie die Unterstützung von SBX über Google DeepVariant und die Open-Source-Suite der XOOS-Tools.

„Sequencing by Expansion“-Technologie (SBX)

AXELIOS 1 ist die Einzelmolekül-Sequenzierplattform der nächsten Generation von Roche. Sie ist die erste, die auf der firmeneigenen „Sequencing by Expansion“-Technologie (SBX) basiert. Die SBX-Technologie ist ein neuartiger Sequenzieransatz, bei dem die Sequenz eines Ziel-Nukleinsäuremoleküls (DNA oder RNA) mithilfe eines ausgeklügelten biochemischen Prozesses in ein messbares Ersatzpolymer, ein sogenanntes „Xpandomer“, kodiert wird. Die Xpandomere, die fünfzigmal länger sind als das ursprüngliche Molekül, kodieren die Sequenzinformation in Reportern mit hohem Signal-to-Noise Ratio, was bedeutet, dass sie beim Durchlaufen einer Nanopore klare Signale mit minimalem Hintergrundrauschen liefern und dadurch die Genauigkeit der Einzelmolekül-Sequenzierung erheblich verbessern sollen. Die Xpandomere werden von einem Sequenziergerät mithilfe eines wiederverwendbaren CMOS-Sensors (Complementary Metal–Oxide–Semiconductor), der Millionen von Nanoporen enthält, gemessen. Diese Architektur ermögliche eine genaue, hochfrequente, flexible und durchsatzstarke Einzelmolekül-Sequenzierung mit nahezu Echtzeit-Analyse. Die SBX-Technologie wurde Anfang 2025 vorgestellt. 

Ausschließlich für Forschungszwecke bestimmt

Die AXELIOS 1 Plattform sei für Flexibilität und Leistung konzipiert worden. Sie könne sowohl für kleinere, schnellere Probenzahlen als auch für größere Projekte eingesetzt werden, ohne dass Systeme oder Arbeitsabläufe angepasst werden müssten. Darüber hinaus sei sie in der Lage, Ergebnisse für das gesamte Genom noch am selben Tag zu liefern. Roche werde Library-Prep-Kits sowie eine kostenlose Open-Source-Bioinformatik-Analysesuite (XOOS) anbieten, die speziell auf die SBX-Technologie zugeschnitten seien. Darüber hinaus sei die Plattform so konzipiert, dass andere Life-Science-Tools flexibel eingesetzt werden könnten, was eine hohe Kompatibilität mit einer breiten Palette von Forschungsanwendungen gewährleiste. AXELIOS 1 ist ausschließlich für Forschungszwecke bestimmt (RUO - research use only). Es ist nicht zur Verwendung in diagnostischen Verfahren zugelassen.

Weitere Informationen unter www.roche.com